Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms