Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLC25A47Q6Q0C1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms