Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms