Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC174Q6PII3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC174Q6PII3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms