Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC41PQ6P2S7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms