Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
APOBEC3HQ6NTF7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3HQ6NTF7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms