Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMBOX1Q6NT76 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms