Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms