Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USPL1Q5W0Q7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms