Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C9orf84Q5VXU9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C9orf84Q5VXU9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C9orf84Q5VXU9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C9orf84Q5VXU9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C9orf84Q5VXU9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C9orf84Q5VXU9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C9orf84Q5VXU9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C9orf84Q5VXU9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C9orf84Q5VXU9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C9orf84Q5VXU9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C9orf84Q5VXU9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C9orf84Q5VXU9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C9orf84Q5VXU9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C9orf84Q5VXU9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C9orf84Q5VXU9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C9orf84Q5VXU9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C9orf84Q5VXU9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C9orf84Q5VXU9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
C9orf84Q5VXU9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C9orf84Q5VXU9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C9orf84Q5VXU9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C9orf84Q5VXU9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
C9orf84Q5VXU9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
C9orf84Q5VXU9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
C9orf84Q5VXU9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms