Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GARNL3Q5VVW2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms