Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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GFI1BQ5VTD9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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GFI1BQ5VTD9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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GFI1BQ5VTD9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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GFI1BQ5VTD9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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GFI1BQ5VTD9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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GFI1BQ5VTD9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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GFI1BQ5VTD9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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GFI1BQ5VTD9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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GFI1BQ5VTD9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GFI1BQ5VTD9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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