Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM164Q5U3C3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms