Protein–RNA interactions for Protein: Q5TA76

LCE3A, Late cornified envelope protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCE3AQ5TA76 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LCE3AQ5TA76 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms