Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFAP70Q5T0N1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
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