Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PIK3CD-AS1Q5SR53 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms