Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RFTN2Q52LD8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms