Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf46Q504U0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms