Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms