Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF212Q495C1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms