Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms