Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms