Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN1Q16799 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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