Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME3Q16798 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME3Q16798 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME3Q16798 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME3Q16798 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME3Q16798 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME3Q16798 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME3Q16798 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME3Q16798 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME3Q16798 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME3Q16798 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME3Q16798 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME3Q16798 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME3Q16798 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME3Q16798 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME3Q16798 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME3Q16798 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME3Q16798 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME3Q16798 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME3Q16798 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME3Q16798 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME3Q16798 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ME3Q16798 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME3Q16798 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME3Q16798 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME3Q16798 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ME3Q16798 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME3Q16798 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME3Q16798 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME3Q16798 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME3Q16798 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME3Q16798 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME3Q16798 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME3Q16798 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME3Q16798 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME3Q16798 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME3Q16798 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ME3Q16798 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME3Q16798 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME3Q16798 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME3Q16798 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME3Q16798 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ME3Q16798 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME3Q16798 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME3Q16798 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME3Q16798 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME3Q16798 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ME3Q16798 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME3Q16798 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME3Q16798 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME3Q16798 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME3Q16798 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME3Q16798 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME3Q16798 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME3Q16798 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME3Q16798 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME3Q16798 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME3Q16798 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME3Q16798 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME3Q16798 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME3Q16798 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME3Q16798 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME3Q16798 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME3Q16798 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME3Q16798 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME3Q16798 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ME3Q16798 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME3Q16798 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME3Q16798 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME3Q16798 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME3Q16798 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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