Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDUFA9Q16795 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFA9Q16795 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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