Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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HIST3H3Q16695 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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HIST3H3Q16695 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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HIST3H3Q16695 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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