Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NREPQ16612 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NREPQ16612 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NREPQ16612 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NREPQ16612 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NREPQ16612 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NREPQ16612 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NREPQ16612 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NREPQ16612 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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NREPQ16612 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NREPQ16612 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NREPQ16612 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NREPQ16612 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NREPQ16612 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NREPQ16612 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NREPQ16612 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NREPQ16612 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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NREPQ16612 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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NREPQ16612 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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NREPQ16612 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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NREPQ16612 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NREPQ16612 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NREPQ16612 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NREPQ16612 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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NREPQ16612 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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NREPQ16612 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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NREPQ16612 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NREPQ16612 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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NREPQ16612 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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NREPQ16612 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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NREPQ16612 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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NREPQ16612 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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NREPQ16612 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NREPQ16612 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NREPQ16612 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NREPQ16612 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NREPQ16612 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NREPQ16612 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NREPQ16612 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NREPQ16612 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NREPQ16612 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NREPQ16612 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NREPQ16612 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NREPQ16612 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NREPQ16612 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NREPQ16612 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NREPQ16612 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NREPQ16612 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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