Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FXNQ16595 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FXNQ16595 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FXNQ16595 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FXNQ16595 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FXNQ16595 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FXNQ16595 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FXNQ16595 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FXNQ16595 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FXNQ16595 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FXNQ16595 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FXNQ16595 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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FXNQ16595 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
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FXNQ16595 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FXNQ16595 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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FXNQ16595 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FXNQ16595 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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FXNQ16595 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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FXNQ16595 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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FXNQ16595 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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FXNQ16595 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FXNQ16595 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FXNQ16595 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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FXNQ16595 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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FXNQ16595 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FXNQ16595 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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FXNQ16595 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FXNQ16595 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FXNQ16595 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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FXNQ16595 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FXNQ16595 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FXNQ16595 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FXNQ16595 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FXNQ16595 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FXNQ16595 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FXNQ16595 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FXNQ16595 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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