Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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SSX1Q16384 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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SSX1Q16384 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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SSX1Q16384 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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