Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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