Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1EQ15878 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1EQ15878 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms