Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SF1Q15637 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SF1Q15637 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SF1Q15637 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SF1Q15637 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SF1Q15637 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SF1Q15637 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SF1Q15637 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SF1Q15637 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SF1Q15637 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SF1Q15637 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SF1Q15637 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SF1Q15637 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SF1Q15637 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SF1Q15637 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SF1Q15637 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SF1Q15637 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SF1Q15637 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SF1Q15637 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SF1Q15637 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SF1Q15637 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SF1Q15637 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SF1Q15637 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SF1Q15637 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SF1Q15637 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SF1Q15637 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SF1Q15637 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SF1Q15637 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SF1Q15637 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SF1Q15637 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SF1Q15637 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SF1Q15637 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SF1Q15637 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SF1Q15637 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SF1Q15637 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SF1Q15637 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SF1Q15637 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SF1Q15637 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SF1Q15637 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SF1Q15637 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SF1Q15637 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SF1Q15637 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SF1Q15637 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SF1Q15637 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SF1Q15637 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SF1Q15637 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SF1Q15637 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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