Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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SEC23BQ15437 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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SEC23BQ15437 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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SEC23BQ15437 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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SEC23BQ15437 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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SEC23BQ15437 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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SEC23BQ15437 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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SEC23BQ15437 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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SEC23BQ15437 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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SEC23BQ15437 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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