Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF1Q15361 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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