Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
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BRD3Q15059 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
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