Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAM2Q15035 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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