Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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