Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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