Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM25Q14258 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms