Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CKAP5Q14008 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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CKAP5Q14008 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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CKAP5Q14008 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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CKAP5Q14008 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CKAP5Q14008 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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