Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE7AQ13946 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE7AQ13946 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE7AQ13946 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE7AQ13946 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE7AQ13946 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE7AQ13946 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE7AQ13946 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE7AQ13946 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE7AQ13946 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE7AQ13946 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE7AQ13946 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE7AQ13946 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE7AQ13946 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE7AQ13946 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE7AQ13946 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE7AQ13946 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE7AQ13946 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE7AQ13946 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE7AQ13946 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE7AQ13946 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE7AQ13946 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE7AQ13946 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE7AQ13946 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE7AQ13946 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE7AQ13946 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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