Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTAN1Q13813 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTAN1Q13813 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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