Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
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