Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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