Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRR1Q13601 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRR1Q13601 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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