Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
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