Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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