Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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