Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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SCGB2A2Q13296 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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SCGB2A2Q13296 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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SCGB2A2Q13296 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SCGB2A2Q13296 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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SCGB2A2Q13296 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SCGB2A2Q13296 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SCGB2A2Q13296 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SCGB2A2Q13296 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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