Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
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